Semi-overcomplete convolutional auto-encoder embedding as shape priors for deep vessel segmentation

Amine Sadikine; Bogdan Badic; Jean-Pierre Tasu; Vincent Noblet; Dimitris Visvikis; Pierre-Henri Conze

Conference papers

Semi-overcomplete convolutional auto-encoder embedding as shape priors for deep vessel segmentation

Amine Sadikine ^{1, 2} Bogdan Badic ^{3, 1} Jean-Pierre Tasu ^{4, 1} Vincent Noblet ^{5, 6} Dimitris Visvikis ^{1, 7} Pierre-Henri Conze ^{8, 1}

1 LaTIM - Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale

2 UBO - Université de Brest

3 CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest

4 CHU Poitiers - Centre hospitalier universitaire de Poitiers

5 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie

6 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique

7 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale

8 IMT Atlantique - ITI - Département lmage et Traitement Information

Amine Sadikine ^{1, 2}
Author

Bogdan Badic ^{3, 1}
Author
PersonId : 1094085

Jean-Pierre Tasu ^{4, 1}
Author

Vincent Noblet ^{5, 6}
Author
PersonId : 1059705

Dimitris Visvikis ^{1, 7}
Author
PersonId : 925839
ORCID : 0000-0003-0831-3637IdRef : 166676241

Pierre-Henri Conze ^{8, 1}
Author
PersonId : 174700
IdHAL : pierre-henri-conzeORCID : 0000-0003-2214-3654IdRef : 238573486

1 LaTIM - Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale (CHRU Morvan, Bâtiment 1, 1er étage, bureau 1056, 2 avenue Foch, 29609 Brest, France - France) StructId : 491118

UBO - Université de Brest (Université de Bretagne Occidentale - 3 Rue des Archives 29238, Brest - France) StructId : 300314
INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : UMR1101 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (France) StructId : 356603
IMT Atlantique - IMT Atlantique (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355
- IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France) StructId : 302102
IBSAM - Institut Brestois Santé Agro Matière (Université de Brest- UBO 29238 Brest - France) StructId : 519898
- UBO - Université de Brest (Université de Bretagne Occidentale - 3 Rue des Archives 29238, Brest - France) StructId : 300314

2 UBO - Université de Brest (Université de Bretagne Occidentale - 3 Rue des Archives 29238, Brest - France) StructId : 300314

3 CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (France) StructId : 356603

4 CHU Poitiers - Centre hospitalier universitaire de Poitiers (2 Rue de la Milétrie, 86021 Poitiers - France) StructId : 300170

5 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (300 bd Sébastien Brant - BP 10413 - F-67412 Illkirch Cedex - France) StructId : 217648

ENGEES - École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (1 quai Koch - BP 61039 - 67070 Strasbourg Cedex - France) StructId : 94023
UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
INSA Strasbourg - Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (France) StructId : 261615
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7357 (France) StructId : 441569
FMNGE - Matériaux et nanosciences d'Alsace (France) StructId : 529627
- UNISTRA - Université de Strasbourg : FR3627 (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
- Université de Haute-Alsace (UHA) - Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (2, rue des Frères Lumière F-68093 Mulhouse Cedex - France) StructId : 237692
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
- INC - Institut de Chimie du CNRS (3 Rue Michel-Ange 75 016 Paris - France) StructId : 341038
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : FR3627 (France) StructId : 441569
Réseau nanophotonique et optique (France) StructId : 529628
- UNISTRA - Université de Strasbourg : FR3678 (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France) StructId : 199013
- Université de Haute-Alsace (UHA) - Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (2, rue des Frères Lumière F-68093 Mulhouse Cedex - France) StructId : 237692
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique (France) StructId : 441569

6 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique (France) StructId : 441569

7 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623

8 IMT Atlantique - ITI - Département lmage et Traitement Information (IMT Atlantique - Campus de Brest :-Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - France) StructId : 489781

IMT Atlantique - IMT Atlantique (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355
- IMT - Institut Mines-Télécom [Paris] (37-39 Rue Dareau, 75014 Paris - France) StructId : 302102

Document type :

Conference papers

Domain :

Computer Science [cs] / Image Processing [eess.IV]

Computer Science [cs] / Medical Imaging

Engineering Sciences [physics] / Signal and Image processing

Complete list of metadata

https://hal-imt-atlantique.archives-ouvertes.fr/hal-03706629
Contributor : Pierre-Henri Conze Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Monday, June 27, 2022 - 9:36:25 PM
Last modification on : Friday, August 5, 2022 - 2:54:52 PM

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HAL Id : hal-03706629, version 1

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Amine Sadikine, Bogdan Badic, Jean-Pierre Tasu, Vincent Noblet, Dimitris Visvikis, et al.. Semi-overcomplete convolutional auto-encoder embedding as shape priors for deep vessel segmentation. IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2022, Bordeaux, France. ⟨hal-03706629⟩

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